Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJC1P36383 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJC1P36383 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJC1P36383 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJC1P36383 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJC1P36383 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJC1P36383 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJC1P36383 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJC1P36383 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJC1P36383 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJC1P36383 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJC1P36383 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJC1P36383 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJC1P36383 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJC1P36383 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJC1P36383 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJC1P36383 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJC1P36383 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJC1P36383 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJC1P36383 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJC1P36383 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJC1P36383 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJC1P36383 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GJC1P36383 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJC1P36383 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJC1P36383 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJC1P36383 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GJC1P36383 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJC1P36383 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GJC1P36383 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GJC1P36383 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJC1P36383 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJC1P36383 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJC1P36383 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJC1P36383 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJC1P36383 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJC1P36383 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJC1P36383 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms