Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX11P35716 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX11P35716 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX11P35716 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX11P35716 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX11P35716 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX11P35716 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX11P35716 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX11P35716 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX11P35716 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX11P35716 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX11P35716 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX11P35716 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX11P35716 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX11P35716 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX11P35716 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX11P35716 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX11P35716 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX11P35716 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX11P35716 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX11P35716 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX11P35716 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX11P35716 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX11P35716 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX11P35716 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX11P35716 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX11P35716 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX11P35716 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX11P35716 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX11P35716 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX11P35716 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX11P35716 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX11P35716 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX11P35716 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SOX11P35716 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SOX11P35716 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SOX11P35716 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SOX11P35716 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SOX11P35716 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SOX11P35716 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SOX11P35716 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX11P35716 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX11P35716 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX11P35716 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms