Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORAP35398 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORAP35398 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms