Protein–RNA interactions for Protein: P30039

PBLD, Phenazine biosynthesis-like domain-containing protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBLDP30039 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBLDP30039 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBLDP30039 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBLDP30039 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBLDP30039 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBLDP30039 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBLDP30039 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBLDP30039 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBLDP30039 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBLDP30039 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBLDP30039 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBLDP30039 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBLDP30039 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBLDP30039 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBLDP30039 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBLDP30039 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBLDP30039 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBLDP30039 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBLDP30039 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBLDP30039 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBLDP30039 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms