Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
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PTPRMP28827 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
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PTPRMP28827 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
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