Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms