Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRGP23470 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
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