Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT1P21579 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT1P21579 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT1P21579 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT1P21579 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT1P21579 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT1P21579 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT1P21579 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT1P21579 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT1P21579 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT1P21579 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT1P21579 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT1P21579 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT1P21579 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT1P21579 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT1P21579 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT1P21579 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT1P21579 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT1P21579 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT1P21579 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT1P21579 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT1P21579 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms