Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms