Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPD1P17405 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms