Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB4P16144 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB4P16144 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB4P16144 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB4P16144 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB4P16144 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB4P16144 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB4P16144 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB4P16144 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB4P16144 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB4P16144 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB4P16144 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB4P16144 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB4P16144 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB4P16144 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB4P16144 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB4P16144 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB4P16144 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB4P16144 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB4P16144 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB4P16144 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB4P16144 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB4P16144 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB4P16144 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB4P16144 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB4P16144 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB4P16144 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB4P16144 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGB4P16144 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms