Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRG2P13727 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRG2P13727 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRG2P13727 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRG2P13727 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRG2P13727 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRG2P13727 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRG2P13727 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRG2P13727 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRG2P13727 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRG2P13727 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRG2P13727 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRG2P13727 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRG2P13727 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRG2P13727 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms