Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms