Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms