Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBP07199 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBP07199 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBP07199 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBP07199 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBP07199 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBP07199 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBP07199 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBP07199 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBP07199 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBP07199 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBP07199 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBP07199 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBP07199 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBP07199 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBP07199 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBP07199 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBP07199 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBP07199 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBP07199 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBP07199 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBP07199 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBP07199 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPBP07199 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPBP07199 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPBP07199 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPBP07199 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPBP07199 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPBP07199 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPBP07199 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPBP07199 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPBP07199 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPBP07199 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPBP07199 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPBP07199 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPBP07199 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPBP07199 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPBP07199 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPBP07199 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPBP07199 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPBP07199 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPBP07199 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPBP07199 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPBP07199 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPBP07199 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPBP07199 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPBP07199 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPBP07199 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPBP07199 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPBP07199 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPBP07199 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPBP07199 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPBP07199 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPBP07199 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPBP07199 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPBP07199 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPBP07199 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPBP07199 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPBP07199 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPBP07199 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPBP07199 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPBP07199 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPBP07199 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPBP07199 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPBP07199 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPBP07199 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPBP07199 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPBP07199 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPBP07199 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPBP07199 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPBP07199 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPBP07199 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPBP07199 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPBP07199 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPBP07199 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPBP07199 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPBP07199 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPBP07199 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPBP07199 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPBP07199 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPBP07199 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPBP07199 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPBP07199 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPBP07199 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPBP07199 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPBP07199 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBP07199 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBP07199 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBP07199 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBP07199 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBP07199 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBP07199 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBP07199 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBP07199 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBP07199 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBP07199 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBP07199 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBP07199 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBP07199 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBP07199 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms