Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGTAO43765 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGTAO43765 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGTAO43765 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGTAO43765 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SGTAO43765 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGTAO43765 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGTAO43765 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGTAO43765 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGTAO43765 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGTAO43765 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGTAO43765 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SGTAO43765 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SGTAO43765 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGTAO43765 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGTAO43765 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGTAO43765 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGTAO43765 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGTAO43765 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGTAO43765 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGTAO43765 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGTAO43765 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGTAO43765 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGTAO43765 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGTAO43765 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGTAO43765 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGTAO43765 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGTAO43765 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGTAO43765 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGTAO43765 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGTAO43765 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGTAO43765 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGTAO43765 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGTAO43765 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGTAO43765 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGTAO43765 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGTAO43765 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGTAO43765 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGTAO43765 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGTAO43765 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGTAO43765 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGTAO43765 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGTAO43765 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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