Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SETD1AO15047 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms