Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN8O00124 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms