Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms