Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms