Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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