Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms