Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms