Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms