Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms