Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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HDGFL3Q9Y3E1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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HDGFL3Q9Y3E1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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