Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms