Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATP8A1Q9Y2Q0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP8A1Q9Y2Q0 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms