Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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