Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms