Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms