Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTNNAL1Q9UBT7 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTNNAL1Q9UBT7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms