Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL42Q9P2K6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms