Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP35Q9P2H5 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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