Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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MIS18AQ9NYP9 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
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MIS18AQ9NYP9 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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MIS18AQ9NYP9 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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MIS18AQ9NYP9 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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MIS18AQ9NYP9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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MIS18AQ9NYP9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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MIS18AQ9NYP9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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MIS18AQ9NYP9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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MIS18AQ9NYP9 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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MIS18AQ9NYP9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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MIS18AQ9NYP9 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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MIS18AQ9NYP9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MIS18AQ9NYP9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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