Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms