Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms