Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOMER3Q9NSC5 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms