Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NECTIN3Q9NQS3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms