Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI1

BRD7, Bromodomain-containing protein 7, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD7Q9NPI1 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRD7Q9NPI1 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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BRD7Q9NPI1 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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BRD7Q9NPI1 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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BRD7Q9NPI1 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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BRD7Q9NPI1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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BRD7Q9NPI1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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BRD7Q9NPI1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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BRD7Q9NPI1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRD7Q9NPI1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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