Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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