Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms