Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP44Q9C0F1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms