Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CIPCQ9C0C6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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