Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM31Q9BZY9 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms