Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ9

KRTAP4-8, Keratin-associated protein 4-8, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-8Q9BYQ9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 PLCE1-AS1-201ENST00000425267 1370 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 NDFIP2-203ENST00000487865 1384 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 CEP57L1-202ENST00000368968 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 CLRN1-201ENST00000295911 1444 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 SH2D4A-202ENST00000518040 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 PHF5A-201ENST00000216252 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 APOBEC2-201ENST00000244669 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 MS4A2-201ENST00000278888 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 RPL12P1-201ENST00000374520 498 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 HLA-DQA1-203ENST00000395363 1206 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 TPTE2P1-202ENST00000429698 770 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC002451.1-202ENST00000432265 771 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AK2-206ENST00000480134 811 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC055758.2-202ENST00000482351 624 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 TMEM267-204ENST00000510130 721 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC01021-205ENST00000514255 545 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC027288.1-201ENST00000548359 816 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 PA2G4-206ENST00000552766 1085 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms