Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms