Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms