Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms