Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3GL3Q99963 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms